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我们发现这两种蛋白质的结构几乎是重叠的，它们的每个褶皱与缝隙、每个凹陷与突出，在三维空间下都不分轩轾。
没受过训练的人完全无法分别这两种蛋白质间的差异。
换言之，尽管组成这两种蛋白质的每块积木都随着时间变迁被替换掉了，但是它们拼出的整体结构（同时结构决定功能）却被进化保存下来。
这就像一座用石块砌成的大教堂，又用砖块重盖，完全保存了整座教堂的宏伟结构。
这促进了另一个真相的揭露，哪一块石块被换掉了？为什么？热泉细菌的酶，构造非常坚固。
其内部化学键像水泥一样将各石块砌在一起，因此尽管受热泉猛烈的高温能量冲击，仍可维持分子结构，就像一座可以抵挡无止境地震的大教堂。
在冰中的酶则相反，这里的石块连接更松散，使其在酷寒的环境中仍可活动，就像一座用滚珠而不是石块盖成的大教堂。
如果在6℃下比较两者的活性，南极细菌酶的催化速度比热泉细菌的高29倍，但是在100℃时，南极细菌的酶会完全瓦解。
浮现在眼前的影像是丰满三维的。
基因的分化也变得有意义了，它们是为了保存酶的结构与功能，为了让同一种酶在两种截然不同的环境下工作。
现在我们可以知道进化的过程中发生了什么，以及为什么，不再只是纸上谈兵，而是真实的洞见。
今日还有许多其他精巧的工具，可以同样真实地带我们洞察过往。
比如说，比较基因组学让我们可以比对数百种生物的全部基因，一次就能比对数千个基因，而不仅仅是比对数个基因。
这要归功于过去几年内各种基因序列陆续解码完成。
而蛋白质组学则让我们可以看到任何时刻，一个细胞里面正在工作的蛋白质，进而我们可以探索，历经万世进化之后，哪一小群基因被保存下来，用来调节这些工作的蛋白质。
计算生物学则帮助我们辨识出蛋白质中统一的形状、结构或模式，尽管编码它们的基因已然不同。
对岩石和化石的同位素分析可以重现过去大气与气候的变化。
成像技术则让我们看到人在思考时大脑内的神经活动，或者重建嵌在岩石里的微观化石的三维结构，而不需要冒险敲碎它们。
还有其他技术，就不一一列举了。
上述这些技术其实没有一项是新的，真正新的地方在于它们的精密度、速度和实用性。
就像人类基因组计划一样，计划的完成速度越来越快，数据累积到了让人目眩神迷的地步。
这些新信息都不是用传统语言如群体遗传学或古生物学所书写，而是用分子，而自然的实际变化就发生在分子等级。
新一代的进化学家正由这些新技术培养起来，他们可以实时记录进化的影响。
他们现在所描绘的景象尺度，从亚原子到行星，其细节与范围都令人叹为观止。
这就是为什么我说，有史以来第一次，我们有了一个答案。
虽然现今积累的大部分知识必定昨是今非，但这些知识都是最生动且有意义的。
能够生在当代是幸福的，因为我们知道如此之多，而且还可以期待知道更多。
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