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第211章 计算生物学研究 二(第2页)

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“控制论的祖师爷维纳说过,控制的本质是信息的负反馈。

但我的目標更激进——我要重塑网络的结构。”

徐辰在白板上写下了一个词:结构可控性。

这是网络科学泰斗巴拉巴西在2011年发表於《nature》封面文章中提出的概念。

他证明了,通过图论中的“最大匹配”

算法,可以找到驱动整个网络的最小节点集合。

这篇论文曾轰动一时,被认为是网络控制领域的里程碑。

但徐辰很快发现了它的局限性。

“巴拉巴西的理论假设网络是线性的,或者是有向无环的。

在这种网络里,信號像水流一样从上游流向下游,你只要控制源头,就能控制整条河。”

“但代谢网络里到处都是反馈环。”

徐辰在白板上画了一个首尾相连的圆圈。

“產物a激活酶b,酶b產生產物c,產物c又反过来抑制酶a。

在这个闭环里,因果关係被锁死了。

它就像一条吞噬自己尾巴的衔尾蛇,没有头,也没有尾。

你根本找不到一个『上游节点来注入控制信號。”

“如果强行控制,信號会在环路里无限放大或震盪,导致系统崩溃。”

为了解决这个问题,徐辰试图切断这些环。

但每一次切断,都可能破坏生物体原本的稳態,导致模型中的细胞“死亡”

这在数学上演变成了一个np-hard问题,也就是非確定性多项式困难问题。

通俗点说,就是这个问题的计算量隨著网络规模的增加呈指数级爆炸。

要在几千个节点、几万条边构成的复杂网络中,找到一组破坏性最小的切断方案,如果用穷举法,哪怕把全世界的计算机都连起来算到宇宙毁灭,也算不完。

整整一周,徐辰都被困在这个逻辑死锁里。

直到第七天的黄昏,他盯著窗外盘旋的鸽群,看著它们在空中画出一个个圆圈,突然意识到自己钻了牛角尖。

“我不需要切断所有环。

我只需要找到那些『环的交集。”

“反馈顶点集!”

这是一个图论中的经典概念。

只要移除这个集合中的节点,图就会变成一个“有向无环图”

“我不需要摧毁环路,我只需要在环路的关键节点上设立『关卡。”

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